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上海大学校内公用高性能计算平台自强4000集群机基本情况
自强4000高性能计算机性能
我校第三代集群式高性能计算机“自强4000”已于2013年6月建成,系统总运算峰值约70万亿次/秒(70Tflops),其中CPU双精度浮点运算峰值57152Gflops,GPU双精度浮点运算峰值14410Gflops,系统总体Linpack效率约为85%。
自强4000高性能计算机系统配置
 CPU计算节点140台,每台2颗Intel SandyBridge架构的E5-2690 CPU(2.9GHz/8-core),64GB内存,共有2240核、8.96TB内存。
 胖节点2台,每台4颗Intel SandyBridge架构的E5-4650 CPU(2.7GHz/8-core),512GB内存,共有64核、1TB内存。
 GPU节点11台,每台2颗Intel SandyBridge架构的E5-2680 CPU(2.7GHz/8-core),64GB内存,共计176核,每台2块NVIDIA M2090 GPU计算模块。
系统内存总量:10TB。
存储系统磁盘总量:180TB。
计算网络:56Gb FDR Infiniband,全线速、无阻塞。
管理网络:千兆以太网。
操作系统:Linux。
作业调度及系统管理与整合:Platform LSF。
并行文件系统:GPFS。
并行环境:Intel Cluster Studio软件工具包,提供Intel C/C++, Fortran Compiler编译器,Intel Math Kernel Library数学库,包含BLAS、LAPACK、Scalapack等,提供跟踪分析器和跟踪采集器;Intel MPI、OpenMPI、MPICH2和MVAPICH等并行编译环境。
系统监控、集群管理:Intel Data Center Manager;IBM xCAT。
我校的高性能计算平台为材料学院、理学院、力学所、环化学院、生命学院、机自学院、土木系、影视学院等研究工作提供科学计算和工程计算,涉及了计算材料钢铁冶金模拟、高分子材料结构分析、计算化学、计算物理、计算力学、流体力学、复杂流动、多相流、交通流、生命科学、生物工程、计算土木工程、骑车模拟、飞机空气动力计算、飞行器温度场、众核并行算法、混合异构环境并行算法等众多研究领域,配合完成国家自然科学基金、863、973和省部级等各级各类项目。